公司股权办理质押流程如下：
1、到工商行政管理机关申请办理股权出质登记；
2、提交有关材料，包括股权出质登记申请书，股权质押合同，出质人持股的证明文件等；
3、工商行政管理机关依法审查材料，办理出质登记。
【法律依据】
《中华人民共和国民法典》第四百二十五条
为担保债务的履行，债务人或者第三人将其动产出质给债权人占有的，债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的实现质权的情形，债权人有权就该动产优先受偿。
前款规定的债务人或者第三人为出质人，债权人为质权人，交付的动产为质押财产。
第四百四十三条
以基金份额、股权出质的，质权自办理出质登记时设立。
基金份额、股权出质后，不得转让，但是出质人与质权人协商同意的除外。出质人转让基金份额、股权所得的价款，应当向质权人提前清偿债务或者提存。